Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BACE1P56817 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BACE1P56817 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms