Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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PGGT1BP53609 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PGGT1BP53609 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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