Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMSP52788 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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SMSP52788 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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SMSP52788 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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SMSP52788 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SMSP52788 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SMSP52788 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SMSP52788 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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SMSP52788 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMSP52788 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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SMSP52788 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMSP52788 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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