Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GCLMP48507 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms