Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCP25054 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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