Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB1P16220 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREB1P16220 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms