Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM200BP0CF97 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FAM200BP0CF97 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FAM200BP0CF97 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FAM200BP0CF97 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FAM200BP0CF97 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM200BP0CF97 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM200BP0CF97 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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