Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLGNO14967 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLGNO14967 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLGNO14967 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms