Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms