Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms