Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms