Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms