Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms