Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms