Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCSER1Q9C0I3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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