Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms