Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms