Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC17Q96LX7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms