Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms