Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms