Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms