Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms