Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms