Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms