Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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