Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NTRK2Q16620 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NTRK2Q16620 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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