Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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