Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms