Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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