Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms