Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTPRJQ12913 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTPRJQ12913 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTPRJQ12913 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTPRJQ12913 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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PTPRJQ12913 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPRJQ12913 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPRJQ12913 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPRJQ12913 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PTPRJQ12913 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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PTPRJQ12913 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PTPRJQ12913 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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