Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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