Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms