Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms