Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms