Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms