Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREMQ03060 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREMQ03060 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREMQ03060 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREMQ03060 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREMQ03060 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREMQ03060 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREMQ03060 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREMQ03060 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREMQ03060 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREMQ03060 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREMQ03060 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREMQ03060 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms