Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP27A1Q02318 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms