Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH6A1Q02252 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms