Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms