Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms