Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms