Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00313P59037 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms