Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA8P53708 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms