Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms