Protein–RNA interactions for Protein: P48741

HSPA7, Putative heat shock 70 kDa protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA7P48741 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPA7P48741 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms