Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RECQLP46063 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RECQLP46063 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RECQLP46063 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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