Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms