Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms