Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX2P28328 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PEX2P28328 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PEX2P28328 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PEX2P28328 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PEX2P28328 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PEX2P28328 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PEX2P28328 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PEX2P28328 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PEX2P28328 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PEX2P28328 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PEX2P28328 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PEX2P28328 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PEX2P28328 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms